加工貿易深加工結轉是指加工貿易企業將保稅進口料件加工的產品轉至另一加工貿易企業進一步加工后復出口的經營活動。其程序分為計劃備案、收發貨登記、結轉報關3個環節。

(1)計劃備案

加工貿易企業開展深加工結轉，轉入、轉出企業應當向各自主管海關提交保稅加工貨物深加工結轉申請表，申報結轉計劃：

①轉出企業在申請表(一式四聯)中填寫本企業的轉出計劃并簽章，憑申請表向轉出地海關備案。

②轉出地海關備案后，留存申請表第一聯，其余三聯退轉出企業交轉人企業。

③轉入企業自轉出地海關備案之日起20日內，持申請表其余三聯，填制本企業的相關內容后，向轉入地海關辦理報備手續并簽章。轉人企業在20日內未遞交申請表，或者雖向海關遞交但因申請表的內容不符合海關規定而未獲準的，該份申請表作

廢。轉出、轉入企業應當重新填報和辦理備案手續。

④轉入地海關審核后，將申請表第二聯留存，第三、第四聯交轉入、轉出企業憑以辦理結轉收發貨登記及報關手續。

(2)收發貨登記

轉出、轉入企業辦理結轉計劃申報手續后，應當按照經雙方海關核準后的申請表進行實際收發貨。

轉出、轉入企業的每批次收發貨記錄應當在保稅貨物實際結轉情況登記表上進行如實登記，并加蓋企業結轉專用名章。

結轉貨物退貨的，轉入、轉出企業應當將實際退貨情況在登記表中進行登記，同時注明“退貨”字樣，并各自加蓋企業結轉專用名章。

(3)結轉報關

轉出、轉入企業實際收發貨后，應當按照以下規定辦理結轉報關手續：

①轉出、轉入企業分別在轉出地、轉入地海關辦理結轉報關手續。轉出、轉人企業可以憑一份申請表分批或者集中辦理報關手續。

轉出企業每批實際發貨后在90日內辦結該批貨物的報關手續，轉入企業每批實際收貨后在90日內辦結該批貨物的報關手續。

②轉入企業憑申請表、登記表等單證向轉人地海關辦理結轉進口報關手續，并在結轉進口報關后的第二個工作臼內將報關情況通知轉出企業。

③轉出企業自接到轉入企業通知之日起10日內，憑申請表、登記表等單證向轉出地海關辦理結轉出口報關手續。

④結轉進口、出口報關的申報價格為結轉貨物的實際成交價格。

⑤一份結轉進口貨物報關單對應一份結轉出口貨物報關單，兩份報關單之間對應的申報序號、商品編號、數量、價格和手冊號應當一致。

⑥結轉貨物分批報關的，企業應當同時提供申請表和登記表的原件及復印件。