目前，集裝箱貨物海上運價體系較內陸運價成熟。基本上分為兩個大類，一類是襲用件雜貨運費計算方法，即以每運費噸為單位(俗稱散貨價)，另一類是以每個集裝箱為計費單位(俗稱包箱價)。

1.件雜貨基本費率加附加費：

(1)基本費率--參照傳統件雜貨運價，以運費噸為計算單位，多數航線上采用等級費率。

(2)附加費--除傳統雜貨所收的常規附加費外，還要加收一些與集裝箱貨物運輸有關的附加費。

2.包箱費率(BOX RATE)：這種費率以每個集裝箱為計費單位，常用于集裝箱交貨的情況，即CFS-CY或CY-CY條款，常見的包箱費率有以下三種表現形式：

(1)FAK包箱費率(FREIGHT FOR ALL KINDS)--即對每一集裝箱不細分箱內貨類，不計貨量(在重要限額之內)統一收取的運價。

(2)FCS包箱費率(FREIGHT FOR CLASS)--按不同貨物等級制定的包箱費率，集裝箱普通貨物的等級劃分與雜貨運輸分法一樣，仍是1-20級，但是集裝箱貨物的費率差級大大小于雜貨費率級差，一般低級的集裝箱收費高于傳統運輸，高價貨集裝箱低于傳統運輸;同一等級的貨物，重貨集裝箱運價高于體積貨運價。可見，船公司鼓勵人們把高價貨和體積貨裝箱運輸。在這種費率下，拼箱貨運費計算與傳統運輸一樣，根據貨物名稱查得等級，計算標準，然后去套相應的費率，乘以運費噸，即得運費。